新疆属于典型的温带大陆性干旱气候，降水稀少、蒸发强烈，年均降水量146.4毫米。水资源总量726.93亿立方米，单位面积产水量仅为全国平均的六分之一。水资源时空分布极不均衡，资源性和工程性缺水并存。

　　新疆三大山脉的积雪、冰川孕育汇集为570多条河流，分布于天山南北的盆地，其中较大的有塔里木河(我国最大的内陆河)、伊犁河、额尔齐斯河(流入北冰洋)、玛纳斯河、乌伦古河、开都河等20 多条。许多河流的两岸，都有无数的绿洲.新疆有许多自然景观优美的湖泊，总面达9700平方公里，约占全疆总面积的0.6%，其中著名的十大湖泊是：博斯腾湖、艾比湖、乌伦古湖(又名布伦托海)、阿雅格库里湖、赛里木湖、阿其格库勒湖、鲸鱼湖、吉力湖、阿克萨依湖、艾西曼湖。

　　新疆境内形成了独具特色的大冰川，共计1.86万余条，总面积2.4万多平方公里，占全国冰川面积的42%，冰储量2.58亿立方米，是新疆的天然“固体水库”。